A Escola Paroquial Nossa Senhora das Mercês, foi fundada em 03 de janeiro de 1931, por Frei D.Inácio Giovani Dal Monte, em colaboração com membros ativos da paróquia e  pela Senhora Aída Teixeira Freitas. O primeiro corpo docente era constituído pela professora Aída Teixeira Freitas, na direção e as professoras normalistas: Amélia Denes, Dalila Saporski e Cecília Teixeira de Freitas.

Com o aumento crescente das matrículas, a direção resolveu apelar para a Congregação das Filhas da Caridade.Portanto, a Escola Vicentina Nossa Senhora das Mercês está sob os cuidados das Filhas da Caridade, desde o ano de 1932, quando assumiram a missão como professoras: Irmã Maria Edler, Irmã Marta Flizinkowski e Irmã Cecília Lechowski.

Em 1941, a direção da Escola passou para as Irmãs e a afluência dos alunos continuava mais e mais. Isso impulsionou a construção de um novo prédio que comportasse o número de alunos e as atividades que estavam sendo desenvolvidas. Com o nome de Instituto Nossa Senhora das Mercês, em 1941, a Escola adquire autonomia não pertencendo mais à Paróquia.

Passando os anos, chegamos a 1954, nova construção, desta vez do atual edifício sendo o mesmo concluído em 1956.

De crescimento em crescimento, a Escola atendeu às necessidades que fizeram parte do seu contexto histórico, adaptando-se às necessidades da época. Assim, nesta Instituição já funcionaram diversas atividades, tais como: Pensionato, Internato,  Conservatório de música, cursos de datilografia, curso de corte e costura e demais trabalhos manuais, Escola de Enfermagem (Etecla), Sede do Secretariado da CRB  e da CNBB, AIC -  Associação Internacional da Caridade  e o  Seminter para atendimento de crianças carentes de 1a a 4a séries. Durante estes anos  forma as futuras Filhas da Caridade através das aspirantes e postulantes.

A partir do ano de 1999, novamente a Escola passa por diversas reformas de ampliação e modernização: - mudança de local, informatização e renovação do acervo da Biblioteca escolar, criação da sala de multimídia - aquisição de novos computadores e modernização do Laboratório de Informática, montagem e compra de equipamentos para o Laboratório de Ciências Naturais - construção do Ginásio Poliesportivo, - reforma dos espaços físicos, ampliação e aquisição de mobiliário e materiais pedagógicos para a Educação Infantil e 1ª. a 4ª. séries, - reformas das instalações dos banheiros internos e externos, pintura externa e interna do prédio, ampliação do sistema administrativo de informática e implantação do novo sistema de telefonia. 

Também houve ampliação da oferta de ensino, a Escola passou a oferecer o Ensino Fundamental de 5ª. a 8ª. séries, período integral  para alunos da Educação Infantil e de 1º. ano a 4ª. séries e  a  partir do ano de 2004 abertura da turma do Nível II, para atendimento às crianças de 02 a 03 anos.